A CREDIPRODESP como instituição financeira tem seu funcionamento autorizado e controlado pelo Banco Central do Brasil, que fiscaliza suas ações através de um departamento específico para as Cooperativas.
Há também as cooperativas centrais com o objetivo de auxiliar e fiscalizar a atuação de suas associadas.
A CREDIPRODESP é filiada à CECRESP que, por autorização do Banco Central, audita as Demonstrações Financeiras das Cooperativas e acompanha suas ações pelos relatórios que mensalmente são encaminhados.
Além disso, a CREDIPRODESP possui um Conselho Fiscal eleito pela Assembleia dos Cooperados, com o objetivo de analisar mensalmente as contas da Cooperativa.
Anualmente, por ocasião da Assembleia Geral dos Cooperados, as contas também são submetidas para analises, questionamentos, aprovação ou rejeição dos cooperados.